Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Efna3O08545 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Efna3O08545 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.7 ms