Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col9a3A2ACT7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col9a3A2ACT7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms