Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms