Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Edf1Q9JMG1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Edf1Q9JMG1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms