Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hmgn5Q9JL35 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hmgn5Q9JL35 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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