Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irx6Q9ER75 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms