Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krt34Q9D646 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt34Q9D646 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms