Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms