Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc30Q8BVF4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc30Q8BVF4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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