Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms