Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MitfQ08874 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MitfQ08874 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 945.9 ms