Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnga1P29974 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms