Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoP15409 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoP15409 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhoP15409 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhoP15409 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoP15409 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RhoP15409 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RhoP15409 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms