Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prf1P10820 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms