Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PnckQ9QYK9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms