Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gps1Q99LD4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gps1Q99LD4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms