Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NipblQ6KCD5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
NipblQ6KCD5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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