Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdr16c6Q05A13 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms