Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psme1P97371 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms