Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cnga1P29974 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnga1P29974 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms