Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kif3aP28741 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kif3aP28741 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms