Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RhoP15409 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RhoP15409 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhoP15409 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhoP15409 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RhoP15409 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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RhoP15409 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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RhoP15409 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoP15409 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoP15409 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoP15409 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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