Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prf1P10820 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prf1P10820 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms