Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxb3P09026 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms