Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Speer4aF8VPX6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms