Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gpc1Q9QZF2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gpc1Q9QZF2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gpc1Q9QZF2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gpc1Q9QZF2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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