Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms