Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rassf9Q8K342 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rassf9Q8K342 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms