Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Knl1Q66JQ7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms