Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfdn6Q03958 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfdn6Q03958 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms