Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psme1P97371 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psme1P97371 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms