Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NclP09405 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NclP09405 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NclP09405 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NclP09405 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NclP09405 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NclP09405 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NclP09405 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NclP09405 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NclP09405 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NclP09405 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NclP09405 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NclP09405 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NclP09405 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NclP09405 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NclP09405 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NclP09405 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms