Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms