Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud3B1AZ99 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms