Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PnckQ9QYK9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PnckQ9QYK9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms