Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Subh2bvQ9D9Z7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Subh2bvQ9D9Z7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms