Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gps1Q99LD4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gps1Q99LD4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 749.3 ms