Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Knl1Q66JQ7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Knl1Q66JQ7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Knl1Q66JQ7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms