Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MitfQ08874 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms