Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psme1P97371 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psme1P97371 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psme1P97371 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psme1P97371 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms