Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cnga1P29974 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnga1P29974 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms