Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm26992S4R1A3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm26992S4R1A3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm26992S4R1A3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm26992S4R1A3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms