Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y8

Plpbp, Pyridoxal phosphate homeostasis protein, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlpbpQ9Z2Y8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PlpbpQ9Z2Y8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PlpbpQ9Z2Y8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PlpbpQ9Z2Y8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PlpbpQ9Z2Y8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PlpbpQ9Z2Y8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms