Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tsc22d3Q9Z2S7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms