Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx39bQ9Z1N5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx39bQ9Z1N5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ddx39bQ9Z1N5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx39bQ9Z1N5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx39bQ9Z1N5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx39bQ9Z1N5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms