Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skp2Q9Z0Z3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skp2Q9Z0Z3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Skp2Q9Z0Z3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Skp2Q9Z0Z3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Skp2Q9Z0Z3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms