Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sh3bgrQ9WUZ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms