Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfc2Q9WUK4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfc2Q9WUK4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfc2Q9WUK4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rfc2Q9WUK4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rfc2Q9WUK4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfc2Q9WUK4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfc2Q9WUK4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rfc2Q9WUK4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rfc2Q9WUK4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rfc2Q9WUK4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms