Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Abcc6Q9R1S7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Abcc6Q9R1S7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Abcc6Q9R1S7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Abcc6Q9R1S7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Abcc6Q9R1S7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Abcc6Q9R1S7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Abcc6Q9R1S7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Abcc6Q9R1S7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms