Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Psmb3Q9R1P1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Psmb3Q9R1P1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psmb3Q9R1P1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psmb3Q9R1P1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms