Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Slit2Q9R1B9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slit2Q9R1B9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Slit2Q9R1B9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Slit2Q9R1B9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Slit2Q9R1B9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Slit2Q9R1B9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Slit2Q9R1B9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms